第三百九十八章 非编码RNA
接下来,庞学林便让吉尔帮忙安排阿什福德的住处,庄园内还有空房间,正好让阿什福德入住。
晚上,庞学林设宴为阿什福德接风洗尘。
肯普滕基地食物补给充足,吉尔准备的宴会上,甚至还出现了牛排、鱼排以及红酒的身影。
吃过晚饭,庞学林挥散众人,然后推着阿什福德来到了院子里。
“庞教授,我觉得我们之间,需要开诚布公谈一谈。”
阿什福德抬头看着庞学林,率先出声道。
“也好,阿什福德先生,你有什么话直接说吧。”
庞学林点了点头,微笑道。
他之所以点名从斯宾塞那里将阿什福德要过来,一方面,阿什福德的父亲老阿什福德当初和斯宾塞、马斯库合作创立了保护伞公司,阿什福德必然知晓保护伞公司许许多多不为人知的秘密。
另一方面,作为一名在T病毒领域浸淫了十几年的顶级学者,庞学林相信阿什福德对于T病毒的了解,比肯普滕基地内的任何人都要来得深。
未来他想要找到对付斯宾塞等人的办法,恐怕得从阿什福德这里入手。
“庞教授,你们对保护伞公司恐怕没什么好感吧?”
庞学林微微一愣,脸上故意露出惊讶之色道:“阿什福德先生,你这话从何而起啊,我现在和斯宾塞先生合作得好好的,而且肯普滕基地的建设也全赖保护伞公司的支援,我怎么会对保护伞公司没好感呢?”
阿什福德哂然一笑,淡淡道:“庞教授,你不必如此戒备,事实上这一点不仅我能看出来,你和斯宾塞之间恐怕也心知肚明。只不过现在你们彼此都需要对方,肯普滕基地的发展需要保护伞公司的财力支持,斯宾塞则希望从你身上找到最终的进化方向,所以你们短时间内不会撕破脸。”
顿了顿,阿什福德继续道:“庞教授,我需要你的帮助。”
“需要我的帮助?”
庞学林愣了愣。
阿什福德眼睛冒出仇恨的光芒,说道:“你应该知道,当年我父亲老阿什福德与马斯库、斯宾塞合作,从西非找到了始祖病毒,创立了安布雷拉公司。一开始,他们的目标是利用始祖病毒的特殊效果,找到人类未来的进化方向,帮助人类攻克癌症、艾滋病之类的绝症。”
“但是随着对始祖病毒研究的深入,他们发现,这种病毒在生化武器上展现出了惊人的潜力。于是在公司未来的发展方向上,我的父亲和马斯库、斯宾塞出现了分歧。当时安布雷拉公司的研发部门很大一部分都是我父亲的人,那些参与这一项目的科学家们都秉持我父亲的理念,希望通过对始祖病毒的研究,为人类的未来做贡献。”
“结果他们为了实现自己的野心,竟然将我父亲控制在实验室内,并且朝他体内注射病毒,将他作为了实验体。之后,他们又对外宣称我父亲主动参与人体实验,结果实验失败,导致了我父亲的死亡。为了安抚公司内属于我父亲那一派系的人马,他们又将我推出来,成为了所谓的保护伞公司三巨头,但实际上,我不过是他们手中的傀儡,之所以将我推出来,不过是为了防止公司出现动荡。可笑的是当时我还傻乎乎的,以为我父亲真的是因为主动参与实验死去的。”
“直到后来,我又遭遇了一场车祸,在车祸中,我虽然失去了双腿,但我却意外得知,这一切都是斯宾塞和马斯库策划的阴谋,我才意识到我被这两人给骗了。后来斯宾塞野心膨胀,又故技重施对马斯库下手,我提前得到消息,故意将这个消息透露给了马斯库,这才是马斯库在诈死十年后重新复活的原因。这些年,阿什福德家族在安布雷拉公司内的影响力日渐衰落,再加上我女儿的关系,这些年,我一直将仇恨忍在心里。我原本想借着马斯库复活,与斯宾塞互斗两败俱伤,我却没想到这两人现在和解了,他们已经见过面,并且决定合作在你那管血液以及T病毒的基础上,开发新一代更为强大的病毒……”
庞学林不由得为之一愣,疑惑道:“马斯库和斯宾塞和解了,为什么?”
庞学林和马斯库、斯宾塞都见过,这两人可不是什么愿意屈居人下的人物。
而且斯宾塞借自己的手毁掉了马斯库手下的埃尔文基地,两人应该更加仇深似海才对啊,又怎么会携起手来呢?
阿什福德摇了摇头道:“具体原因我也不清楚,但是这是我亲眼所见,而且这些年阿什福德家族在保护伞公司内虽然没有了多少影响力,但保护伞公司内部还是有一部分人忠于阿什福德家族的,根据我的人传回的消息,目前保护伞公司内部,忠于马斯库与忠于斯宾塞的人马正在重新合作……”
说完这些,阿什福德抬起头,眼睛一眨不眨盯着庞学林道:“庞教授,现在只有你能帮我了……”
庞学林面无表情道:“阿什福德博士,你女儿现在还在斯宾塞手中吧?你现在劝我和斯宾塞作对,你就不担心你女儿的安全吗?”
阿什福德脸上露出一丝苦涩之意,说道:“马斯库和斯宾塞合流,我在保护伞公司内部的力量非常有限,如今人为刀俎我为鱼肉,我们父女俩只是他手中的傀儡,如果不是我手里还掌握着一些关于T病毒的关键数据,我恐怕早就死了。现在我别无他法,只有愤起一击,才有可能摆脱斯宾塞的掌控。”
庞学林没有出声,只是静静地看着阿什福德。
“庞教授,你还不信我么?”
庞学林没有说话,过了好一会儿才淡淡道:“阿什福德博士,假如我帮你的话,你能为我带来什么呢?”
阿什福德眼睛一亮,说道:“庞教授,你是从蜂巢实验室出来的,你应该知道T病毒的可怕,但是假如我说,我手里掌握着T病毒的弱点,你信吗?”
“T病毒的弱点?”
庞学林微微一愣。
阿什福德点头道:“斯宾塞在技术领域天赋一般,当年斯宾塞‘杀死’马斯库后,关于T病毒的研究便陷入了停滞状态,直到我在生物学领域展现了遗传自我父亲的天赋,于是斯宾塞便将T病毒的研究工作交到了我的手里。这些年我虽然一直在按照斯宾塞的要求研发新一代的生化兵器,诸如暴君,舔食者都出自于我的手笔。但是在研究这些武器的过程中,我也一直在试图寻找破解T病毒的办法,还真让我发现了一些线索……”
“什么线索?”
“庞教授,你应该听说过非编码RNA吧?”
庞学林点了点头。
“自从二十世纪五十年代沃森和克里克提出了著名的DNA双螺旋结构模型,以及后来确定了遗传信息流从DNA→RNA→蛋白质这样的中心法则以来,我们认识到,生物体内的复杂结构和功能是由基因组上一段成为基因的DNA序列及其表达的蛋白质决定的。因此,基因组上的基因也就被称为编码序列,它能够编码一种蛋白质的氨基酸序列。”
“但随着我们进一步研究却发现,基因组上的编码序列(就是指基因),实际上只占了基因组的一小部分,在人类基因组中,编码序列只占了百分之三,剩下百分之九十七的DNA序列,都无法编码任何的多肽或者蛋白质。这一部分DNA就是所谓的非编码序列。而且随着我们对众多生物体的研究,我们发现,低等生物体,比如病毒,细菌等等,它们的体内只有少数非编码序列,而高等动植物体内则含有大量的非编码序列,它们占据了基因组的绝大部分。”
“而中心法则告诉我们,基因组中的DNA发挥功能的重要方式就是转录产生RNA,近年来我们的研究表明,基因组内的绝大部分DNA都是可以转录成RNA的,因此,非编码RNA就是有基因组内的非编码序列转录而成的,同时也有越来越多的证据表明,这些非编码RNA在生命活动中,起到了非常重要的作用。其中最突出的两个例子便是RNA干涉和microRNA的研究。”
“RNA干涉的研究源于转录后的基因沉默现象,这一现象最早发现与矮牵牛和少数几种植物中。这种特殊的现象表现为,当对这些植物进行转基因后,导入的基因和其相似的内源基因都是都被抑制,进一步的实验表明同源转录确实出现过,但很快就被降解了。”
“科学家们对RNA干涉现象做进一步深入研究后发现:dsRNA一旦进入细胞内,就会被一个称为Dicer的特定酶切割成21~23个核苷酸长度的小分子干扰RNA(siRNA)片段。Dicer酶属于RNaseIII家族中能够特异识别双链RNA的成员,它以ATP依赖的方式切割由外源导入或者由转基因、病毒感染等各种方式引入的双链RNA,切割产生的siRNA片段随后与一些酶结合成为了诱导沉默复合体。激活的诱导沉默复合体通过碱基配对定位到与siRNA同源的mRNA转录本上,并且在距离siRNA3'端一定的位置切割该mRNA,这样就是的与mRNA此相对应的基因陷入沉默状态。大量的研究表明,RNA干涉现象广泛存在于从真菌到植物,从无脊椎动物到哺乳动物的各种生物体内,甚至也存在于一些低等原核生物中。”
“当年蜂巢实验室内的一位科学家曾经提出了这样的设想,基因沉默现象很可能是生物体进化过程中用来抵御转座子或者RNA病毒的一种防御机制,是生物体使用的一种古老的抗病毒策略,甚至可能在植物与动物发生分化之前就已经出现了。”
庞学林的脸上流露出若有所思的表情,说道:“你的意思是,通过对基因沉默现象的研究,或许能够帮助我们找到对抗RNA病毒的办法?”
阿什福德摇了摇头,说道:“基因沉默只是可以让人类对部分RNA病毒免疫,让幸存的人类可以在未来避免被T病毒和它的同源病毒感染。真正想要消灭T病毒,我们还有很长一段路要走。”
庞学林笑了起来,说道:“你刚才不是说除了RNA干扰现象外,还有microRNA吗?说说这种RNA吧。”
阿什福德点了点头,说道:“上世纪八十年代,我接手蜂巢实验室不就,在一次研究中,我手下的一个实验组以线虫为对象用基因打靶技术研究某些基因对其发育的影响。我们找到了一个对发育有明显干扰基因,通常线虫要经过四个幼虫阶段才能成熟,这个基因的突变可以使它的发育只停留在第一阶段。然后让我们惊讶的是,这个基因同样不编码任何蛋白质,而是只编码一个microRNA。”
“而这种microRNA,竟然对线虫体内的T病毒起到了一定程度的抑制作用。”
“后来我们发现,这种microRNA属于庞大的非编码RNA家族中的一员,这些年,保护伞公司旗下的实验室发现了成千上万种非编码RNA分子,这些RNA分子组成了相互作用网络,参与了细胞体内的生命活动调节,它们与蛋白质-蛋白质相互作用网络相对应,就好比宇宙学中的暗物质与亮物质。之前,在生命科学界,我们一直以为生物的功能是由蛋白质实现的,因此我们以蛋白质为中心进行了大量的研究,发现了大量关于蛋白质产生、调控和代谢的途径及相关网络。而随着非编码RNA及其生物学功能的大规模发现,将有助于我们寻找到非编码RNA彼此之间,乃至于与蛋白质之间的相互作用网络……”
阿什福德顿了顿,说道:“甚至于,我认为关于T病毒的解药,就隐藏在千千万万的非编码RNA之中,就看我们能不能把它给找出来了。”
庞学林静静地看着阿什福德,许久之后,他伸出手微笑道:“阿什福德博士,合作愉快。”
阿什福德微微一愣,脸上露出笑容道:“庞教授,合作愉快!”
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晚上,庞学林设宴为阿什福德接风洗尘。
肯普滕基地食物补给充足,吉尔准备的宴会上,甚至还出现了牛排、鱼排以及红酒的身影。
吃过晚饭,庞学林挥散众人,然后推着阿什福德来到了院子里。
“庞教授,我觉得我们之间,需要开诚布公谈一谈。”
阿什福德抬头看着庞学林,率先出声道。
“也好,阿什福德先生,你有什么话直接说吧。”
庞学林点了点头,微笑道。
他之所以点名从斯宾塞那里将阿什福德要过来,一方面,阿什福德的父亲老阿什福德当初和斯宾塞、马斯库合作创立了保护伞公司,阿什福德必然知晓保护伞公司许许多多不为人知的秘密。
另一方面,作为一名在T病毒领域浸淫了十几年的顶级学者,庞学林相信阿什福德对于T病毒的了解,比肯普滕基地内的任何人都要来得深。
未来他想要找到对付斯宾塞等人的办法,恐怕得从阿什福德这里入手。
“庞教授,你们对保护伞公司恐怕没什么好感吧?”
庞学林微微一愣,脸上故意露出惊讶之色道:“阿什福德先生,你这话从何而起啊,我现在和斯宾塞先生合作得好好的,而且肯普滕基地的建设也全赖保护伞公司的支援,我怎么会对保护伞公司没好感呢?”
阿什福德哂然一笑,淡淡道:“庞教授,你不必如此戒备,事实上这一点不仅我能看出来,你和斯宾塞之间恐怕也心知肚明。只不过现在你们彼此都需要对方,肯普滕基地的发展需要保护伞公司的财力支持,斯宾塞则希望从你身上找到最终的进化方向,所以你们短时间内不会撕破脸。”
顿了顿,阿什福德继续道:“庞教授,我需要你的帮助。”
“需要我的帮助?”
庞学林愣了愣。
阿什福德眼睛冒出仇恨的光芒,说道:“你应该知道,当年我父亲老阿什福德与马斯库、斯宾塞合作,从西非找到了始祖病毒,创立了安布雷拉公司。一开始,他们的目标是利用始祖病毒的特殊效果,找到人类未来的进化方向,帮助人类攻克癌症、艾滋病之类的绝症。”
“但是随着对始祖病毒研究的深入,他们发现,这种病毒在生化武器上展现出了惊人的潜力。于是在公司未来的发展方向上,我的父亲和马斯库、斯宾塞出现了分歧。当时安布雷拉公司的研发部门很大一部分都是我父亲的人,那些参与这一项目的科学家们都秉持我父亲的理念,希望通过对始祖病毒的研究,为人类的未来做贡献。”
“结果他们为了实现自己的野心,竟然将我父亲控制在实验室内,并且朝他体内注射病毒,将他作为了实验体。之后,他们又对外宣称我父亲主动参与人体实验,结果实验失败,导致了我父亲的死亡。为了安抚公司内属于我父亲那一派系的人马,他们又将我推出来,成为了所谓的保护伞公司三巨头,但实际上,我不过是他们手中的傀儡,之所以将我推出来,不过是为了防止公司出现动荡。可笑的是当时我还傻乎乎的,以为我父亲真的是因为主动参与实验死去的。”
“直到后来,我又遭遇了一场车祸,在车祸中,我虽然失去了双腿,但我却意外得知,这一切都是斯宾塞和马斯库策划的阴谋,我才意识到我被这两人给骗了。后来斯宾塞野心膨胀,又故技重施对马斯库下手,我提前得到消息,故意将这个消息透露给了马斯库,这才是马斯库在诈死十年后重新复活的原因。这些年,阿什福德家族在安布雷拉公司内的影响力日渐衰落,再加上我女儿的关系,这些年,我一直将仇恨忍在心里。我原本想借着马斯库复活,与斯宾塞互斗两败俱伤,我却没想到这两人现在和解了,他们已经见过面,并且决定合作在你那管血液以及T病毒的基础上,开发新一代更为强大的病毒……”
庞学林不由得为之一愣,疑惑道:“马斯库和斯宾塞和解了,为什么?”
庞学林和马斯库、斯宾塞都见过,这两人可不是什么愿意屈居人下的人物。
而且斯宾塞借自己的手毁掉了马斯库手下的埃尔文基地,两人应该更加仇深似海才对啊,又怎么会携起手来呢?
阿什福德摇了摇头道:“具体原因我也不清楚,但是这是我亲眼所见,而且这些年阿什福德家族在保护伞公司内虽然没有了多少影响力,但保护伞公司内部还是有一部分人忠于阿什福德家族的,根据我的人传回的消息,目前保护伞公司内部,忠于马斯库与忠于斯宾塞的人马正在重新合作……”
说完这些,阿什福德抬起头,眼睛一眨不眨盯着庞学林道:“庞教授,现在只有你能帮我了……”
庞学林面无表情道:“阿什福德博士,你女儿现在还在斯宾塞手中吧?你现在劝我和斯宾塞作对,你就不担心你女儿的安全吗?”
阿什福德脸上露出一丝苦涩之意,说道:“马斯库和斯宾塞合流,我在保护伞公司内部的力量非常有限,如今人为刀俎我为鱼肉,我们父女俩只是他手中的傀儡,如果不是我手里还掌握着一些关于T病毒的关键数据,我恐怕早就死了。现在我别无他法,只有愤起一击,才有可能摆脱斯宾塞的掌控。”
庞学林没有出声,只是静静地看着阿什福德。
“庞教授,你还不信我么?”
庞学林没有说话,过了好一会儿才淡淡道:“阿什福德博士,假如我帮你的话,你能为我带来什么呢?”
阿什福德眼睛一亮,说道:“庞教授,你是从蜂巢实验室出来的,你应该知道T病毒的可怕,但是假如我说,我手里掌握着T病毒的弱点,你信吗?”
“T病毒的弱点?”
庞学林微微一愣。
阿什福德点头道:“斯宾塞在技术领域天赋一般,当年斯宾塞‘杀死’马斯库后,关于T病毒的研究便陷入了停滞状态,直到我在生物学领域展现了遗传自我父亲的天赋,于是斯宾塞便将T病毒的研究工作交到了我的手里。这些年我虽然一直在按照斯宾塞的要求研发新一代的生化兵器,诸如暴君,舔食者都出自于我的手笔。但是在研究这些武器的过程中,我也一直在试图寻找破解T病毒的办法,还真让我发现了一些线索……”
“什么线索?”
“庞教授,你应该听说过非编码RNA吧?”
庞学林点了点头。
“自从二十世纪五十年代沃森和克里克提出了著名的DNA双螺旋结构模型,以及后来确定了遗传信息流从DNA→RNA→蛋白质这样的中心法则以来,我们认识到,生物体内的复杂结构和功能是由基因组上一段成为基因的DNA序列及其表达的蛋白质决定的。因此,基因组上的基因也就被称为编码序列,它能够编码一种蛋白质的氨基酸序列。”
“但随着我们进一步研究却发现,基因组上的编码序列(就是指基因),实际上只占了基因组的一小部分,在人类基因组中,编码序列只占了百分之三,剩下百分之九十七的DNA序列,都无法编码任何的多肽或者蛋白质。这一部分DNA就是所谓的非编码序列。而且随着我们对众多生物体的研究,我们发现,低等生物体,比如病毒,细菌等等,它们的体内只有少数非编码序列,而高等动植物体内则含有大量的非编码序列,它们占据了基因组的绝大部分。”
“而中心法则告诉我们,基因组中的DNA发挥功能的重要方式就是转录产生RNA,近年来我们的研究表明,基因组内的绝大部分DNA都是可以转录成RNA的,因此,非编码RNA就是有基因组内的非编码序列转录而成的,同时也有越来越多的证据表明,这些非编码RNA在生命活动中,起到了非常重要的作用。其中最突出的两个例子便是RNA干涉和microRNA的研究。”
“RNA干涉的研究源于转录后的基因沉默现象,这一现象最早发现与矮牵牛和少数几种植物中。这种特殊的现象表现为,当对这些植物进行转基因后,导入的基因和其相似的内源基因都是都被抑制,进一步的实验表明同源转录确实出现过,但很快就被降解了。”
“科学家们对RNA干涉现象做进一步深入研究后发现:dsRNA一旦进入细胞内,就会被一个称为Dicer的特定酶切割成21~23个核苷酸长度的小分子干扰RNA(siRNA)片段。Dicer酶属于RNaseIII家族中能够特异识别双链RNA的成员,它以ATP依赖的方式切割由外源导入或者由转基因、病毒感染等各种方式引入的双链RNA,切割产生的siRNA片段随后与一些酶结合成为了诱导沉默复合体。激活的诱导沉默复合体通过碱基配对定位到与siRNA同源的mRNA转录本上,并且在距离siRNA3'端一定的位置切割该mRNA,这样就是的与mRNA此相对应的基因陷入沉默状态。大量的研究表明,RNA干涉现象广泛存在于从真菌到植物,从无脊椎动物到哺乳动物的各种生物体内,甚至也存在于一些低等原核生物中。”
“当年蜂巢实验室内的一位科学家曾经提出了这样的设想,基因沉默现象很可能是生物体进化过程中用来抵御转座子或者RNA病毒的一种防御机制,是生物体使用的一种古老的抗病毒策略,甚至可能在植物与动物发生分化之前就已经出现了。”
庞学林的脸上流露出若有所思的表情,说道:“你的意思是,通过对基因沉默现象的研究,或许能够帮助我们找到对抗RNA病毒的办法?”
阿什福德摇了摇头,说道:“基因沉默只是可以让人类对部分RNA病毒免疫,让幸存的人类可以在未来避免被T病毒和它的同源病毒感染。真正想要消灭T病毒,我们还有很长一段路要走。”
庞学林笑了起来,说道:“你刚才不是说除了RNA干扰现象外,还有microRNA吗?说说这种RNA吧。”
阿什福德点了点头,说道:“上世纪八十年代,我接手蜂巢实验室不就,在一次研究中,我手下的一个实验组以线虫为对象用基因打靶技术研究某些基因对其发育的影响。我们找到了一个对发育有明显干扰基因,通常线虫要经过四个幼虫阶段才能成熟,这个基因的突变可以使它的发育只停留在第一阶段。然后让我们惊讶的是,这个基因同样不编码任何蛋白质,而是只编码一个microRNA。”
“而这种microRNA,竟然对线虫体内的T病毒起到了一定程度的抑制作用。”
“后来我们发现,这种microRNA属于庞大的非编码RNA家族中的一员,这些年,保护伞公司旗下的实验室发现了成千上万种非编码RNA分子,这些RNA分子组成了相互作用网络,参与了细胞体内的生命活动调节,它们与蛋白质-蛋白质相互作用网络相对应,就好比宇宙学中的暗物质与亮物质。之前,在生命科学界,我们一直以为生物的功能是由蛋白质实现的,因此我们以蛋白质为中心进行了大量的研究,发现了大量关于蛋白质产生、调控和代谢的途径及相关网络。而随着非编码RNA及其生物学功能的大规模发现,将有助于我们寻找到非编码RNA彼此之间,乃至于与蛋白质之间的相互作用网络……”
阿什福德顿了顿,说道:“甚至于,我认为关于T病毒的解药,就隐藏在千千万万的非编码RNA之中,就看我们能不能把它给找出来了。”
庞学林静静地看着阿什福德,许久之后,他伸出手微笑道:“阿什福德博士,合作愉快。”
阿什福德微微一愣,脸上露出笑容道:“庞教授,合作愉快!”
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